就在司马迁把他家里那部《太史公记》副本藏在博济医馆的密室后不久，汉武帝刘彻就下令命司马迁把他的《太史公记》呈上来阅读，于是司马迁便拿着宫里的这部正本给了刘彻看。
刘彻刚开始看得津津有味，足足看了一个月，一边看一边盛赞司马迁的文采，夸他是大文豪大手笔。但是当他看到高祖、惠帝、文帝、景帝的本纪时，就开始感觉不对了，司马迁那种敢秉笔直书的气概令他很不爽，当刘彻看到自己的本纪时，更是震怒，气得把简牍都要摔烂；后来再看一些关于本朝的酷吏等人的传后，更是怒不可遏，下令将这部《太史公记》烧掉。好在司马迁的文笔很好，一直都在刘彻身边帮他写东西，才免得一死。当然刘彻不杀司马迁还有一层意思就是想让他看看，因为他知道司马迁不畏死，于是就偏不成全他，如果他把司马迁杀了就会落得杀忠臣的坏名声，后世的史学家就会说他的坏话。
可怜的司马迁，虽然他知道还有一副本藏着密室，但是看着自己一生的心血被烧掉的那一刹那，他还是痛哭流涕，而后更是晕了过去，被人抬回家里。
公孙彧从杨恽那得知司马迁因他的《太史公记》被烧掉而晕过去后，便拿起药囊匆匆赶来尚冠前街的司马迁府。
司马迁这倔老头这时已经奄奄一息地躺在床上，他的女儿司马英正在床边照料他，他那两个在外地当官的儿子也在赶回来，看样子司马迁应该时日不多了。
见到公孙彧前来帮他治病，司马迁想开口说话却怎么也没有力气说出话来，想举起手都举不起。公孙彧忙上前示意他好好休息，并帮他把脉，发现脉象寸口动而弱，动则心受惊，弱则受悸，再观其脸色青白，于是诊断为由于司马迁太激愤而导致惊悸症，于是拿出他刚和易素素一起研制成功的琥珀救心丸给司马迁服下。
琥珀救心丸是易素素在翻看仓公诊籍时看到的，其实是她爷爷易道安和奶奶淳于缇萦所创的，里面的材料有：琥珀、龙齿、远志、菖蒲、茯神、人参、枣仁、生地、当归，这些天来公孙彧和易素素一直在研究其药性，并在此基础上再加入黄连、柏子仁、朱砂、牛黄这四味药下去炮制，方得这种琥珀救心丸，其效是益气强心，对那些气虚血瘀所致的惊悸症效果更佳。
司马迁连服用几天琥珀救心丸后，虽恢复了一些元气，可以说话和活动四肢，但还是卧床不起。
这天，公孙彧估计司马迁的药差不多服完了，又急忙赶到司马迁府上送药，顺便再看看他的病情如何。
见到公孙彧送药过来，司马迁忙用手招他靠近些。公孙彧再帮他把脉，观其脸色，发现病情虽是好了些，但身子仍是虚弱，恐怕难好起来。
看来司马迁还是放心不下他那部巨着，只见他一手抓住公孙彧，另一手抓住杨恽，此时屋里也只有他们三个，于是他用那微弱的声音慢慢说道：“你们俩个要看好《太史公记》，今后如能遇到明君，你们可将它献出，如若能流传下去，我死也瞑目。”
公孙彧微笑着对他说道：“大人请放心，决不会让它落入歹人之手，他日如若遇到明君，必将献出；我昨夜幽梦时，有一白发老者托梦给我，说大人您的巨着能够流芳百世，您的名声更是几千年后还在远扬；他还说一千年后也有一个司马氏继续您的事业，再续一千年史书。”
公孙彧不敢说他有现代的记忆和思维，不能将一千年后司马光的《资治通鉴》如实跟他说，因为说了他也不信，只能说是白发老者托梦，其实自司马迁写完《史记》后，历朝历代都开始重视修史，并涌现出《二十四史》、《三国志》等史书，这些都是司马迁所想不到的，当然公孙彧也没有一一说出来，怕他不相信。
司马迁淡淡一笑，心想你也学田千秋来一个白发老翁托梦来哄我开心，其实这个白发老翁公孙彧用的比田千秋还早呢。
“能够流传下来就心满意足了，我的后人如果也能继承我的事业那更好。”
公孙彧听出司马迁有点不信，也难怪，那是往后发生的事，不过既然他都是不久于人世了，说出也无妨，于是继续说道：“大人，你也别恨皇上，他确是有雄才大略，那位梦中白发老者还在梦中跟我说道，皇上和前朝的秦始皇都是千古一帝，他们俩人所创的基业那是千秋万代的；特别是皇上，能把匈奴人赶走，使我朝屹立不倒；他还说，两千年后继续生活在这片大地上的人大多都叫汉人，是以我朝的国号来称呼的。”
司马迁听后笑而不语，或者此时他不是很相信，但确是这样。只见他沉思片刻后，紧握公孙彧的手说道：“你的那部《黄帝内经》一定要整理好，也一定要流传下去，你知道我为什么要为扁鹊和仓公立传吗？本来我还是有点担忧的，但自从看了密室里面的医简后，我更加坚信我专为他俩立传是正确的。”
司马迁顿了一顿，估计是连续说话有点累吧，公孙彧和杨恽则在旁边安静地听他继续说道：“扁鹊的医经虽说不全是他写的，但是他却开创了辑写医经的先河，因此他乃医经派的始祖；而仓公虽是继承了扁鹊和阳庆他们的医术和医简，但是他也开创了写诊籍的先河，故他是经方派的始祖。”
听到这里，公孙彧终于明白了，点点头说：“扁鹊之所以为神医，就是他创立了医经，而仓公则在医经的基础上创立了经方派，但我想着两派也可糅合在一起，形成我们的汉医。”
司马迁终于露出由衷的笑容，轻声说道：“这个任务也只有你来完成了。”
听到司马迁对自己的肯定，公孙彧也是有的受宠若惊，有点不好意思地说道：“也不知道能不能完成，我尽力吧，不过像神仙术和房中术也可以一起糅合进去。”
司马迁微微地点点头，表示赞同，公孙彧继续说道：“其实什么修炼成仙，什么长生不老，说到底就是养生，神仙术就是养生术；而房中术也是很重要的，它就是被人利用来享乐，其实房中术用在生儿育女这方面才是正确的，我们都知道怎样传宗接代，但如何优生优育，房中术是可以指导的。”
公孙彧一口气说了养生、优生优育等现代的词语，听得司马迁频频点头，但不知他能不能理解。
天色也将晚了，公孙彧怕打扰司马迁的休息，便辞别回医馆。谁知再过三天，杨恽急匆匆跑过来找他过去司马府，一进门就见到司马迁已经断气了，一代史学家就这样走了。
子长少不羁，发轫遍丘壑。
晚遭李陵祸，愤悱思远托。
高辞振幽光，直笔诛隐恶。
驰骋数千载，贯穿百家作。
至今青简上，文彩炳金雘。
高才忽小疵，难用常情度。
譬彼海运鹏，岂复顾缯缴。
区区班叔皮，未易议疏略。