SEELE，没有人知道这个神秘组织起源于何时，也没有人知道他们到底有多大的能量。
唯一能够知晓的是，在SEELE的努力下，整个世界第一次组成了联合国军，第一次制造出了一个超国家的组织-NERV！全世界都为同一个目标而联合在一起，各国出钱出人，组建成了一个以对抗使徒保护世界为己任的超国际组织。所有参与进来的人都以自己的职责为荣，但是他们不知道的是，这一切都是假象！一切的一切都是SEELE自导自演的剧目。所有人在这个剧目中都是受到SEELE操控的木偶，身不由己。
在一处幽深的地底之下，十三座石碑依次亮起，石碑上依次浮现了古拉丁文代表的数字1，2，3，4，直到第十二个石碑Ⅻ亮起后，十二道人影出现在这个神圣的祭坛之上。
“十三号犹大已经背叛了我们！”
“需要给与他惩罚吗？”
第七号和第八号石碑上的人影发言道。
“不用，十三号的背叛是命运，也是计划书中的一环，他将是我们原罪的献祭者，只有犹大的背叛，才能带来我等人类的升华！”一号石碑上，一位略显老迈的身影发声道。
“NERV的使命即将完成，所有的生命之果即将回归亚当，而智慧之果尽皆归于莉莉丝！只要我等完成最后的承诺，人类必将迎来最终的归宿！新世纪的大门将为我等开启！”
“启动最后的预案，神临之日即将到来！”
随着一号石碑上老者的发言，另外十一位石碑上的身影齐齐发出附议，他们犹如进行宗教仪式一般，向着冥冥中不可描述的存在发出了自己的宣言。
世界毁灭的倒计时开始了！
。。。
最近一段时间，碇真嗣非常的烦恼，他甚至开始怀疑起自己战斗的目的。
使徒到底是什么？
EVA又是什么？
自己的父亲到底想要做什么？难道真的是像他自己说的那样，拯救世界？
别开玩笑了，如果拯救世界就是杀死别人，杀死别的生命，这样的世界有什么好拯救的！
而这一切源于他最后一场的战斗。
之前的使徒都是长得奇形怪状的怪物，那时候他可以毫不犹豫的将对方当做异类进行排除，但是等到第五适格者渚薰来到NERV后，情况发生了根本性的扭转。
白衬衫，黑长裤，棕灰的头发，红色的眼睛，这位名为渚薰的少年犹如一股拂面而来的清风，吹进了碇真嗣的心里。
但是碇真嗣绝对没有想到的是，这名在他内心深处留下重重一笔的少年居然是使徒。
使徒怎么会是人类，人类怎么会是使徒？
觉得遭受欺骗的碇真嗣疯狂的驾驶初号机攻击渚薰！
他要讨一个说法，他要问问渚薰，为什么要欺骗他，为什么使徒要和人类战斗，为什么明明是敌人还要和他做朋友。
但这一切的疑问都在渚薰自愿赴死后化为了泡影！
明明拥有最强的AT立场，甚至能够将EVA当做自己的奴仆进行战斗，身体强横到可以不需要任何防护就站立在月球表面，无视致命的太空辐射和恐怖的超低温！
此时的渚薰就像是进化到终极的人类一样，以凡人之躯，驾驭天神之力！
但是如此强大的存在，却甘心散去身上所有防护，让碇真嗣操控初号机活活的将他捏死！
但即使面对死亡，他也依然微笑着说道：
“对于我来说，生与死都是等价的。”
“我本应是第一使徒，堕落之后却成为了第十三使徒，开始和结束真的是一样的！”
“真嗣，也许，我的出生是为了遇见你！”
“这一次，我一定要会让你幸福的。”
说着意义不明的话语，渚薰坦荡的迎接了自己的死亡。
不过临死之前，这位拥有红色瞳孔的少年深深的看了一眼远处，似乎再像某个特殊的存在说话一般。
“异界来客，请记住我们的约定！”
一段心灵之音传递到了云启的脑海中，让云启久久不能平静。
渚薰，代表人类形态进化到极致的存在。
当看到渚薰的第一眼时，云启就感觉到了极度的危险感。虽然对方的意识极度单纯，但是潜藏在渚薰单纯意识之下的是庞大到令人恐惧的灵魂。
云启毫不怀疑，如果对方真的有杀死他的念头，自己根本抗不过十分钟。
不过对方似乎并不能完全调用那庞大的灵魂之力，反倒是更多的只是粗浅的运用了其中一部分力量来生成AT立场，制造出了生命果实。
云启几乎可以保证，对方看似脆弱的肉身其实充满了恐怖到爆炸的力量。
在生命之果提供的生命之力滋润下，渚薰的身体根本不会衰老，也不会生病。
这是真正的不死之躯，除非他自愿离去，否则就算将他的肉体全部粉碎，他也能再次复活，回到人间。
一个如此神秘的存在，自然令云启相当忌惮。根据SEELE的资料显示，对方是在第二次冲击的时候诞生，然后SEELE曾经在他的身体里植入了第一使徒亚当的一部分，造就了这个最强的适格者！
渚薰和EVA的同步率直接超越了机器能够显示的极限。
与其说那是操控，不如说渚薰是在控制自己原本的身体。
根据这些证据，云启猜测对方体内那令您自己都感到恐惧的东西很有可能是第一使徒亚当的灵魂。
只有一位曾经的真神灵魂才会让自己这位黄金巅峰的精神力者感到巨大的压力。
不过有意思的是，明明云启不想接触渚薰，但是这名少年却主动的找上了自己，还和自己达成了一个约定。
想着自己脑海中的约定内容，云启心中不禁有些古怪，对方是如何知道自己是穿越者的呢？又是如何肯定自己会出手帮忙的的呢？
这一切都是一个谜，不过云启相信，自己迟早会找出这个秘密，而且对方的约定看似很难，但是早已经有所准备的云启心中已经有了一个大概的计划！
现在就是看谁的底牌更加厉害了。
距离最终决战的日子越来越近了，NERV，SEELE，以及唯一的例外云启，三方都在暗中准备自己的底牌，准备在这个最终的战场上决一胜负了！